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2018年11月2日Science期刊精華
  • 發布日期:2018-11-09      瀏覽次數:2277
    • 本周又有一期新的Science期刊(2018年11月2日)發布,它有哪些精彩研究呢?讓小編一一道來。
       

      圖片來自Science期刊。


      1.Science:重磅!揭示帕金森病中的腦細胞死亡機制
      doi:10.1126/science.aat8407; doi:10.1126/science.aav3986


      在一項新的研究中,來自美國約翰霍普金斯大學等研究機構的研究人員以小鼠作為研究對象,鑒定出導致與帕金森病相關的身體和智力退化的一連串細胞死亡事件。這一結果可能為開發阻斷帕金森病進展的藥物提供新的靶點。相關研究結果發表在2018年11月2日的Science期刊上,論文標題為“Poly(ADP-ribose) drives pathologic α-synuclein neurodegeneration in Parkinson’s disease”。論文通信作者為約翰霍普金斯大學醫學院細胞工程學院主任Ted Dawson博士和約翰霍普金斯大學醫學院神經學教授Valina Dawson博士。論文作者為約翰霍普金斯大學醫學院的Tae-In Kam、Xiaobo Mao和Hyejin Park。

      這項研究著重關注一種特定的稱為Parthanatos的“程序化(programmed)”細胞死亡通路。這種通路是神經細胞退化的關鍵驅動因素。它不同于其他已知的程序性細胞死亡形式,比如細胞凋亡和壞死性凋亡(通常由于疾病或損傷導致的細胞死亡)。在帕金森病中,Parthanatos通路的步是在大腦神經元中錯誤折疊蛋白的堆積。這些稱為α突觸核蛋白(alpha synuclein)的蛋白長期以來一直與帕金森病進展有關,但是人們并不清楚它們是如何特異性地影響腦細胞的。

      這些研究人員隨后測試了阻斷PARP1是否能夠拯救這些腦細胞免于死亡。在另一項實驗中,他們再次將α突觸核蛋白團塊添加到健康小鼠的腦細胞中,接著用阻斷PARP1功能的三種藥物---維利帕尼(veliparib, 別名ABT-888),魯卡帕尼(rucaparib, 別名AG-014699)和他拉唑帕尼(talazoparib, 別名BMN 673),當前被腫瘤學家用于治療乳腺癌和卵巢癌---中的一種處理這些腦細胞。他們發現,利用這些藥物處理的細胞在14天內免受死亡。

      為了在活的哺乳動物中測試這一點,這些研究人員將α突觸核蛋白團塊注射到正常小鼠和經過基因改造缺乏PARP基因的小鼠的大腦中。他們發現,正常小鼠開始表現出肌肉無力,協調感缺失和運動減少,正如在注射三個月后測試它們的握力和從一根垂直桿子上爬下來的能力中觀察到的那樣。然而,缺乏PARP的小鼠和正常小鼠接受PARP阻斷劑治療后均未表現出這些能力的下降。

      2.Science:利用人工智能預測RNA病毒的動物宿主和傳播媒介
      doi:10.1126/science.aap9072; doi:10.1126/science.aav4265


      如今,在一項新的研究中,來自蘇格蘭格拉斯哥大學等研究機構的研究人員設計出一種新的機器學習算法,它利用病毒基因組序列預測一系列RNA病毒的可能的自然宿主,其中RNA病毒是常見的從病毒跳躍到人類中的病毒群體。相關研究結果發表在2018年11月2日的Science期刊上,論文標題為“Predicting reservoir hosts and arthropod vectors from evolutionary signatures in RNA virus genomes”。

      這些研究人員研究了500多種單鏈RNA病毒的基因組,來訓練這種機器學習算法,以便將嵌入在病毒基因組中的模式與病毒的動物起源相匹配。這種機器學習算法能夠準確地預測每種病毒來自哪個動物宿主,每種病毒是否需要吸血的動物媒介,如果需要的的話,這種動物媒介是蜱、蚊子、蠓蟲還是白蛉。

      接下來,這些研究人員將這種機器學習算法應用于寨卡病毒和中東呼吸綜合征冠狀病毒(MERS-CoV),以及宿主和動物媒介尚不為人所知的病毒,如克里米亞-剛果出血熱(Crimean Congo Hemorrhagic Fever)病毒。

      3.Science:重磅!鑒定出大腦中的姿勢細胞
      doi:10.1126/science.aau2013; doi:10.1126/science.aav3819


      在一項新的研究中,來自挪威科技大學的研究人員在大鼠大腦中分離出一組可調整大鼠姿勢的神經細胞。相關研究結果發表在2018年11月2日的Science期刊上,論文標題為“Efficient cortical coding of 3D posture in freely behaving rats”。英國倫敦大學學院的Guifen Chen針對這項研究在同期Science期刊上發表了一篇標題為“Identifying posture cells in the brain”的觀點類型文章。 

      為了更多地了解大腦如何處理定位,這些研究人員在一只受試大鼠的周圍設置了六個攝像頭,以便觀察和記錄它在狹窄的空間中的運動,并通過六個自由度跟蹤它的姿勢。他們還將一個硅探頭插入到受試大鼠的大腦中,以便觀察不同的大腦區域是否變得活躍。這種設置允許他們將大鼠腦部不同部位的神經活動與某些身體姿勢(比如坐在后退上)進行比較。

      這些研究人員發現后頂葉皮質和額葉運動皮層中的神經元與姿勢的變化存在關聯。這種關聯性是如此密切以至于他們能夠通過簡單地觀察這兩個大腦區域中的神經活動來預測大鼠所采取的姿勢。

      4.Science:新型的四合一抗體有望幫助人類抵御多種流感病毒的感染
      doi:10.1126/science.aaq0620


      日前,一項刊登在雜志Science上的研究報告中,來自美國斯克里普斯研究所等機構的科學家們通過研究開發了一種抵御流感病毒感染的新型四合一抗體策略,文章中,研究人員描述了他們如何開發這種新型抗體,并將其在小鼠機體中進行檢測。

      此前研究中,研究人員通過研究發現,羊駝能夠產生一種特殊類型的抗體,這種抗體能夠吸附流感病毒的脆弱部分,隨后研究者將含有三種不同類型失活流感病毒的疫苗注射到受試羊駝體內,同時這種疫苗中還含有來自另外兩種類型流感病毒的病毒表面蛋白,一旦羊駝體內產生了應對新引進流感病毒的抗體后,研究人員就對這些抗體進行收獲(即這種抗體可以應對四種流感病毒)。下一步研究者對基因進行工程化修飾,使其能夠表達特殊的蛋白,而這種蛋白由來自羊駝體內的四種納米抗體組成,后研究者對工程化基因進行剪接過程并且重組成為良性病毒。

      為了檢測這種方法,研究者開發了一種鼻腔噴霧,其能將所攜帶的病毒送入檢測小鼠的鼻腔中,隨后研究者利用能夠感染人類的59種流感病毒來感染小鼠,結果表明,這種新型的四合一抗體能夠幫助小鼠成功抵御每一種流感病毒的感染。

      5.Science:如何利用老藥沙利度胺來幫助開發新型癌癥療法?
      doi:10.1126/science.aat0572


      近日,一項刊登在雜志Science上的研究報告中,來自MIT博德研究所等機構的科學家們通過研究發現,沙利度胺以及相關的藥物或能為研究人員提供一種研究起點來開發一類新型的抗癌化合物,這種化合物有望靶向作用擁有相同基序的大約800種轉錄因子。轉錄因子能與DNA結合并協調多個基因的表達,而這通常是特殊細胞類型或組織的特殊模式;這些蛋白一旦發生錯誤將會與很多癌癥相關,但研究者們發現,要想將其作為藥物開發的目標或許困難重重,這是因為,轉錄因子常常會缺失藥物分子與其直接接觸的位點。

      沙利度胺及其化學親屬:泊馬度胺(pomalidomide)和來那度胺(lenalidomide)都能通過征召一種名為cereblon的蛋白質來間接攻擊其靶點—兩種擁有C2H2 ZF的轉錄因子:IKZF1和IKZF3,cereblon是一種稱之為E3泛素連接酶的特殊分子及其,其能為標記特殊蛋白供細胞循環系統降解。當沙利度胺及其親屬分子缺失時,cereblon就會忽略IKZF1和IKZF3;而當其存在時,就會促進cereblon識別這些轉錄因子并且對其進行標記以便處理。

      人類基因組能夠編碼大約800個轉錄因子,比如IKZF1和IKZF3,其能夠忍受C2H2 ZF基序的某些突變;識別能夠幫助藥物開發的某些特殊因素或能幫助研究人員發現是否其它類似的轉錄因子會容易受到沙利度胺樣藥物的影響。當沙利度胺樣的藥物存在時,研究人員就能夠確定蛋白cereblon所觀察到的的C2H2 ZF的特性,隨后其就會篩選沙利度胺、泊馬度胺和來那度胺誘發細胞模型中6572種特殊的C2H2 ZF基序變異發生降解的能力,后研究者發現了6種含有C2H2 ZF的蛋白質會對這些藥物變得敏感,其中有4種此前人員并不認為其能作為沙利度胺及其親屬化合物的作用靶點。

      隨后研究人員對IKZF1和IKZF3進行功能性和結構性來更好地理解轉錄因子、cereblon及其沙利度胺之間相互作用的機制,此外,研究者還運行了4661個突變的計算機模型來觀察是否能夠預測在藥物存在時會有其它的轉錄因子與cereblon進行對接。研究者表示,合適修飾的沙利度胺樣藥物應該誘導cereblon對特殊亞型的C2H2 ZF轉錄因子進行標記來對其重新利用。

      6.Science:腸道菌群可選擇真菌表型
      doi:10.1126/science.aat0537; doi:10.1126/science.aav3374


      白色念珠菌等真菌在哺乳動物的腸道中發現到,但是人們對它們在那里所做的事情知之甚少。 Gloria Hoi Wan Tso等人通過在利用抗生素處理而缺乏腸道細菌的小鼠中連續傳代讓白色念珠菌處于進化壓力下。這種連續傳代加速真菌突變,特別是在FLO8基因周圍,從而導致不能形成菌絲的低毒力表型出現。然而,這些表型刺激了促炎細胞因子產生,從而給腸道中的幾種其他的表型提供短暫的交叉保護。然而,如果這些小鼠存在完整的腸道菌群,那么僅毒性的可產生菌絲的表型形式持續存在。 

      7.Science:從結構上揭示核小體DNA轉錄過程
      doi:10.1126/science.aau9904


      在真核生物中,當RNA聚合酶II(RNAPII)對DNA上的遺傳信息進行轉錄時,作為染色質的基本單元,核小體由DNA和組蛋白組成,它會阻止RNAPII。Tomoya Kujirai等人利用低溫電鏡技術探究了RNAPII-核小體復合物的7種結構,其中在這種復合物中,RNAPII停靠在核小體的四個位置上。這些對RNAPII前行的連續快照揭示出RNAPII如何逐步地將核小體中的DNA從組蛋白上剝離下來的分子機制。(生物谷 )

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